早在百年之前，土山湾孤儿院就开始了彩绘玻璃的制作和生产。由于彩绘玻璃的制作涉及到绘画技巧，因此花玻璃工场附设于图画馆。根据《徐汇纪略》的介绍：“近日新添彩绘玻璃，将人物鸟兽彩画于玻璃上，后置炉中煨炙，彩色深入玻璃内，永久不退，中国彩绘玻璃，此为 出品处。”可见，土山湾是国内彩绘玻璃制作和生产的鼻祖，产品主要供应全国各地的教堂。随着年代的更替，上海教区现有的圣堂中，除了洋泾浜天主堂保留有一部分的彩绘玻璃原物之外，其它所有的教堂都是通过翻修的机会复原或是新添了新彩绘玻璃。而洋泾浜天主堂的彩绘玻璃完全是舶来品，当时的土山湾还没有制作和生产彩绘玻璃的技术。

由于没有直射光进入建筑物，所有光线都经过彩色玻璃过滤，让整个大教堂处于一种绝对的静穆中，安静而从容不迫，更加具有中世纪信仰的神圣性。
在餐厅的设计中引入了观光的概念。室内是澳门现代化和历史的缩影。私人餐厅“TATO”的设计灵感来自地标性建筑澳门塔。餐厅柜台呈半圆形，围绕着一根柱子，形成类似于观景台的结构。柱顶延伸至天花板并向外辐射，形成象征天空的空中图案。另一方面，主餐厅则是对澳门历史的一种揭示。圣保罗遗址、议事亭前地、葡式瓷砖、教堂彩色玻璃等建筑遗迹是关键的装饰元素。