而教堂的彩色玻璃，不仅给教堂内带来了光明，也给教堂笼罩上一种神秘的氛围。彩色玻璃上都是一些宗教故事，是为了当年一些不识字的信徒更直观地了解宗教而制作的。

玫瑰花窗作为哥特式建筑的特色之一，在很多中世纪教堂的正门上方都有着一个大圆形窗，镶嵌着很多美丽的彩绘玻璃，最为著名的玫瑰窗就是巴黎圣母院中的玫瑰花窗，作为彩绘玻璃当中的一种，但是玫瑰花窗给人的感觉却更为震撼
这些彩色玻璃花窗是世界上保存最完整、最典型的中世纪彩色玻璃杰作。围绕着圣经故事，这些花窗描绘出近五千个拜占庭风格的人物，它使整个大教堂成为“一座彩色玻璃博物馆”。
在餐厅的设计中引入了观光的概念。室内是澳门现代化和历史的缩影。私人餐厅“TATO”的设计灵感来自地标性建筑澳门塔。餐厅柜台呈半圆形，围绕着一根柱子，形成类似于观景台的结构。柱顶延伸至天花板并向外辐射，形成象征天空的空中图案。另一方面，主餐厅则是对澳门历史的一种揭示。圣保罗遗址、议事亭前地、葡式瓷砖、教堂彩色玻璃等建筑遗迹是关键的装饰元素。